В ДНК современных людей обнаружены следы двух ранее неизвестных науке архаичных родственников человека. Это генетическое наследие дополняет то, что было получено от неандертальцев и денисовцев, и подтверждает, что эволюция человека представляла собой сложную сеть контактов и скрещиваний между различными популяциями гоминин.

Учёные из Калифорнийского университета в Беркли выявили в геноме человека участки, унаследованные от этих вымерших групп, и оценили время их контактов с Homo sapiens. Одна из этих популяций, которую исследователи условно называют «призрачной», скрещивалась с предками современных людей в Африке более 50 тысяч лет назад. Это произошло до последней крупной волны миграции Homo sapiens из Африки в Европу и Азию. От этой линии все современные люди, включая африканцев, унаследовали около 1% своего генома. Сама «призрачная» линия отделилась от предков современного человека примерно 800 тысяч лет назад.
Вторая группа оказалась ещё древнее – это сверхархаичная популяция, чья эволюционная линия обособилась около 1,8 млн лет назад. Эти гоминины, вероятно, скрещивались с денисовцами в Евразии более 200 тысяч лет назад. Позже денисовцы передали часть полученных генов предкам современных людей. В результате небольшая доля ДНК этой сверхархаичной популяции попала в геном человека. Наибольшая её концентрация наблюдается у жителей Океании, унаследовавших до 4% своей ДНК от денисовцев.
Открытие удалось сделать благодаря новому вычислительному методу TRACE, который не требует образцов древней ДНК из ископаемых останков. Вместо этого он анализирует геномы сотен ныне живущих людей и реконструирует древние генеалогические связи между последовательностями ДНК. Метод выявляет участки генома, чьё происхождение уходит в прошлое необычно далеко, что указывает на их архаичный источник.
Новые данные окончательно опровергают упрощённую модель эволюции человека в виде ветвящегося дерева. История человечества скорее напоминает сложную сеть, в которой популяции постоянно мигрировали и смешивались. Учёные предполагают, что гены, полученные от архаичных родственников, могли помогать Homo sapiens адаптироваться к новым условиям – например, к патогенам или источникам пищи в незнакомой среде. Личности «призрачного» и сверхархаичного предков пока не установлены, но, по оценкам, они могут быть связаны с гомининами среднего плейстоцена и популяциями Homo erectus соответственно. Результаты исследования опубликованы в журнале Science.