Международная группа ученых впервые реконструировала древние геномы бетагерпесвирусов человека 6A и 6B (ВГЧ-6A/B), используя ДНК из археологических останков возрастом более 2000 лет. Исследование под руководством специалистов из Венского университета и Университета Тарту показало, что эти вирусы тесно связаны с людьми как минимум со времен Железного века, подтвердив их длительную совместную эволюцию.
Вирус герпеса человека 6B (ВГЧ-6B) заражает около 90 процентов детей в возрасте до двух лет и известен как возбудитель детской розеолы – или «шестой болезни», – самой частой причины фебрильных судорог у младенцев. Вместе со своим близким родственником ВГЧ-6A он относится к распространенной группе герпесвирусов, которые вызывают легкую первичную инфекцию, а затем остаются в организме в неактивном состоянии на всю жизнь.
Отличительной чертой этих вирусов является их уникальная способность встраивать свой генетический материал в хромосомы человека. Это позволяет вирусу долгое время оставаться «спящим» и в редких случаях передаваться от родителя к ребенку как часть человеческого генома. Сегодня около одного процента людей в мире являются носителями таких унаследованных вирусных копий. Ученые давно предполагали, что эта интеграция происходила в далеком прошлом, но прямых генетических доказательств до сих пор не было.
В поисках вирусной ДНК команда проанализировала почти 4000 образцов человеческих скелетов с археологических раскопок по всей Европе. Из этого огромного набора данных удалось успешно выделить и реконструировать одиннадцать древних геномов герпесвируса. Самый старый из них принадлежал молодой девушке, жившей в Италии в Железном веке (1100–600 гг. до н.э.).
Другие образцы охватывали широкий диапазон эпох и мест. Оба типа вируса, ВГЧ-6A и ВГЧ-6B, были обнаружены в средневековых останках из Англии, Бельгии и Эстонии, а ВГЧ-6B также нашли в древних образцах из Италии и раннеисторической России. Несколько человек из Англии оказались носителями унаследованных форм ВГЧ-6B, что делает их самыми ранними известными случаями хромосомно-интегрированного вируса герпеса. Особенно выделилось бельгийское захоронение Синт-Трёйден, где было зафиксировано наибольшее число случаев и признаки циркуляции обоих штаммов вируса в одном сообществе.
«Хотя ВГЧ-6 заражает почти 90% населения в какой-то момент жизни, лишь около 1% являются носителями вируса, унаследованного от родителей, во всех клетках тела. Именно эти случаи мы, скорее всего, можем идентифицировать с помощью древней ДНК, что делает поиск вирусных последовательностей довольно сложным», – пояснила ведущий исследователь Мериам Гуэллиль из Венского университета. – «Основываясь на наших данных, эволюцию вирусов теперь можно проследить на протяжении более 2500 лет по всей Европе, используя геномы с VIII–VI веков до нашей эры и до наших дней».
Реконструкция древних геномов позволила точно определить, в каких местах вирусы встраивались в хромосомы человека. Сравнение с современными генетическими данными показало, что некоторые вирусные интеграции произошли тысячи лет назад и передавались через многие поколения. Анализ также выявил, что ВГЧ-6A и ВГЧ-6B шли разными эволюционными путями. Один из них, ВГЧ-6A, со временем, по-видимому, утратил способность интегрироваться в ДНК человека, что указывает на изменение его взаимодействия с хозяином в процессе совместной эволюции.
Наличие унаследованной копии ВГЧ-6B в геноме сегодня связывают с повышенным риском стенокардии и болезней сердца. «Мы знаем, что унаследованные формы ВГЧ-6A и B сегодня чаще встречаются в Великобритании по сравнению с остальной Европой, и это первое доказательство существования древних носителей из Британии», – говорит Шарлотта Хоулдкрофт из Кембриджского университета.
Открытие древних геномов ВГЧ-6 стало первым генетическим доказательством долгосрочной коэволюции вируса и человека с точной датировкой. Хотя ВГЧ-6A и ВГЧ-6B были идентифицированы только в 1980-х годах, новое исследование прослеживает их присутствие до Железного века, демонстрируя, как кратковременные детские инфекции могут в конечном итоге стать частью генома человека.
